Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3GL2Q99962 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3GL2Q99962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3GL2Q99962 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3GL2Q99962 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms