Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTRCQ99895 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTRCQ99895 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTRCQ99895 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTRCQ99895 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms