Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ODF3Q96PU9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ODF3Q96PU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF3Q96PU9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF3Q96PU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms