Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK2Q96PF2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK2Q96PF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK2Q96PF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK2Q96PF2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms