Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZIM3Q96PE6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZIM3Q96PE6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZIM3Q96PE6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZIM3Q96PE6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZIM3Q96PE6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms