Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC115Q96NT0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC115Q96NT0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC115Q96NT0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms