Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL15Q96M94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL15Q96M94 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL15Q96M94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL15Q96M94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL15Q96M94 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms