Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00477Q96M19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00477Q96M19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00477Q96M19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00477Q96M19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms