Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71F1Q96KD3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71F1Q96KD3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM71F1Q96KD3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM71F1Q96KD3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM71F1Q96KD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms