Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSL1Q96IY1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSL1Q96IY1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSL1Q96IY1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NSL1Q96IY1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms