Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms