Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJA3Q96EY1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAJA3Q96EY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJA3Q96EY1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJA3Q96EY1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms