Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF31Q96EP0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF31Q96EP0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF31Q96EP0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF31Q96EP0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms