Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLAMF9Q96A28 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLAMF9Q96A28 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLAMF9Q96A28 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLAMF9Q96A28 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLAMF9Q96A28 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLAMF9Q96A28 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLAMF9Q96A28 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLAMF9Q96A28 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLAMF9Q96A28 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms