Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A4Q969I6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC38A4Q969I6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A4Q969I6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A4Q969I6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms