Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP13Q92995 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP13Q92995 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP13Q92995 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP13Q92995 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP13Q92995 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP13Q92995 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP13Q92995 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP13Q92995 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP13Q92995 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP13Q92995 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP13Q92995 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP13Q92995 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP13Q92995 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP13Q92995 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP13Q92995 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP13Q92995 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP13Q92995 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP13Q92995 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP13Q92995 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP13Q92995 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP13Q92995 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP13Q92995 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP13Q92995 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP13Q92995 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP13Q92995 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP13Q92995 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP13Q92995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP13Q92995 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP13Q92995 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP13Q92995 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP13Q92995 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP13Q92995 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP13Q92995 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP13Q92995 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP13Q92995 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP13Q92995 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP13Q92995 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP13Q92995 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP13Q92995 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP13Q92995 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP13Q92995 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP13Q92995 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP13Q92995 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP13Q92995 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP13Q92995 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP13Q92995 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP13Q92995 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP13Q92995 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP13Q92995 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP13Q92995 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP13Q92995 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP13Q92995 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP13Q92995 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP13Q92995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP13Q92995 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP13Q92995 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP13Q92995 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP13Q92995 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP13Q92995 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP13Q92995 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP13Q92995 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP13Q92995 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP13Q92995 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP13Q92995 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP13Q92995 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP13Q92995 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP13Q92995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP13Q92995 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP13Q92995 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP13Q92995 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP13Q92995 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP13Q92995 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP13Q92995 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP13Q92995 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP13Q92995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP13Q92995 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP13Q92995 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP13Q92995 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP13Q92995 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP13Q92995 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP13Q92995 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP13Q92995 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP13Q92995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP13Q92995 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP13Q92995 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP13Q92995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP13Q92995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP13Q92995 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP13Q92995 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP13Q92995 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP13Q92995 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP13Q92995 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP13Q92995 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP13Q92995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP13Q92995 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms