Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB8BQ92930 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB8BQ92930 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB8BQ92930 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB8BQ92930 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB8BQ92930 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms