Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFFLQ8WZ73 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RFFLQ8WZ73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFFLQ8WZ73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFFLQ8WZ73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFFLQ8WZ73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms