Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SKA2Q8WVK7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKA2Q8WVK7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKA2Q8WVK7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKA2Q8WVK7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms