Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRSK1Q8TDC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK1Q8TDC3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK1Q8TDC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRSK1Q8TDC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRSK1Q8TDC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BRSK1Q8TDC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK1Q8TDC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms