Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HELBQ8NG08 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HELBQ8NG08 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HELBQ8NG08 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HELBQ8NG08 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
HELBQ8NG08 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HELBQ8NG08 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HELBQ8NG08 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HELBQ8NG08 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HELBQ8NG08 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms