Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEST4Q8NFU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST4Q8NFU0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEST4Q8NFU0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEST4Q8NFU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEST4Q8NFU0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST4Q8NFU0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEST4Q8NFU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms