Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
USP32Q8NFA0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
USP32Q8NFA0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
USP32Q8NFA0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
USP32Q8NFA0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
USP32Q8NFA0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
USP32Q8NFA0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
USP32Q8NFA0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
USP32Q8NFA0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms