Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG2

C7orf57, Uncharacterized protein C7orf57, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf57Q8NEG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C7orf57Q8NEG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C7orf57Q8NEG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C7orf57Q8NEG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C7orf57Q8NEG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C7orf57Q8NEG2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C7orf57Q8NEG2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C7orf57Q8NEG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C7orf57Q8NEG2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C7orf57Q8NEG2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms