Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BHLHE23Q8NDY6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE23Q8NDY6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE23Q8NDY6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE23Q8NDY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms