Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZR5

CMTM4, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4Q8IZR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM4Q8IZR5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM4Q8IZR5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM4Q8IZR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM4Q8IZR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM4Q8IZR5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms