Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC2Q8IXK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC2Q8IXK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHC2Q8IXK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHC2Q8IXK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHC2Q8IXK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms