Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LOXHD1Q8IVV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LOXHD1Q8IVV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LOXHD1Q8IVV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LOXHD1Q8IVV2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LOXHD1Q8IVV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
LOXHD1Q8IVV2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LOXHD1Q8IVV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LOXHD1Q8IVV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms