Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC80Q76M96 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC80Q76M96 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC80Q76M96 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms