Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMUB2Q71RG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMUB2Q71RG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMUB2Q71RG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms