Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWJ1

STXBP4, Syntaxin-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP4Q6ZWJ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STXBP4Q6ZWJ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STXBP4Q6ZWJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STXBP4Q6ZWJ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STXBP4Q6ZWJ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STXBP4Q6ZWJ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STXBP4Q6ZWJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms