Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FAM47EQ6ZV65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM47EQ6ZV65 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM47EQ6ZV65 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms