Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM43BQ6ZT52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM43BQ6ZT52 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM43BQ6ZT52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM43BQ6ZT52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM43BQ6ZT52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM43BQ6ZT52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM43BQ6ZT52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms