Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LIAT1Q6ZQX7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LIAT1Q6ZQX7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIAT1Q6ZQX7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIAT1Q6ZQX7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms