Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASC2Q6XLA1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASC2Q6XLA1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASC2Q6XLA1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASC2Q6XLA1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms