Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBLN3Q6UW01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBLN3Q6UW01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLN3Q6UW01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLN3Q6UW01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLN3Q6UW01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLN3Q6UW01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms