Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNV1Q6PIU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNV1Q6PIU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNV1Q6PIU1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNV1Q6PIU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KCNV1Q6PIU1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNV1Q6PIU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNV1Q6PIU1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms