Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf88Q6PI97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C11orf88Q6PI97 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf88Q6PI97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf88Q6PI97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf88Q6PI97 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms