Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CHIC1Q5VXU3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CHIC1Q5VXU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CHIC1Q5VXU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CHIC1Q5VXU3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CHIC1Q5VXU3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
CHIC1Q5VXU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.13■■■■■ 4.66
CHIC1Q5VXU3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CHIC1Q5VXU3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CHIC1Q5VXU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
CHIC1Q5VXU3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CHIC1Q5VXU3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CHIC1Q5VXU3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CHIC1Q5VXU3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CHIC1Q5VXU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
CHIC1Q5VXU3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CHIC1Q5VXU3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
CHIC1Q5VXU3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
CHIC1Q5VXU3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CHIC1Q5VXU3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms