Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF5Q5TYX0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF5Q5TYX0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF5Q5TYX0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms