Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF14Q5SWL7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF14Q5SWL7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF14Q5SWL7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF14Q5SWL7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF14Q5SWL7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF14Q5SWL7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF14Q5SWL7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF14Q5SWL7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF14Q5SWL7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF14Q5SWL7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF14Q5SWL7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms