Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SAMD9Q5K651 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SAMD9Q5K651 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SAMD9Q5K651 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SAMD9Q5K651 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SAMD9Q5K651 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
SAMD9Q5K651 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SAMD9Q5K651 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SAMD9Q5K651 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SAMD9Q5K651 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SAMD9Q5K651 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SAMD9Q5K651 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SAMD9Q5K651 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SAMD9Q5K651 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SAMD9Q5K651 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
SAMD9Q5K651 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SAMD9Q5K651 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms