Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9K5

ZMAT1, Zinc finger matrin-type protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT1Q5H9K5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMAT1Q5H9K5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZMAT1Q5H9K5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZMAT1Q5H9K5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZMAT1Q5H9K5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZMAT1Q5H9K5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms