Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q56UQ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q56UQ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q56UQ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q56UQ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q56UQ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q56UQ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q56UQ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q56UQ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q56UQ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q56UQ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q56UQ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q56UQ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q56UQ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q56UQ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q56UQ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q56UQ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q56UQ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q56UQ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q56UQ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q56UQ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q56UQ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q56UQ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q56UQ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q56UQ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q56UQ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q56UQ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q56UQ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q56UQ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q56UQ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q56UQ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q56UQ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q56UQ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q56UQ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q56UQ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q56UQ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q56UQ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q56UQ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q56UQ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q56UQ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q56UQ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q56UQ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q56UQ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q56UQ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q56UQ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q56UQ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q56UQ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q56UQ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q56UQ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q56UQ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q56UQ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q56UQ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q56UQ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q56UQ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q56UQ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q56UQ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q56UQ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q56UQ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q56UQ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q56UQ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q56UQ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q56UQ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q56UQ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q56UQ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q56UQ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q56UQ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q56UQ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q56UQ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q56UQ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q56UQ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q56UQ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q56UQ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q56UQ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q56UQ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q56UQ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q56UQ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q56UQ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms