Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HS1BP3Q53T59 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HS1BP3Q53T59 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HS1BP3Q53T59 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HS1BP3Q53T59 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HS1BP3Q53T59 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HS1BP3Q53T59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HS1BP3Q53T59 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HS1BP3Q53T59 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HS1BP3Q53T59 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HS1BP3Q53T59 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HS1BP3Q53T59 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms