Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC58Q4VC31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC58Q4VC31 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC58Q4VC31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC58Q4VC31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms