Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC01620Q4KN68 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01620Q4KN68 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01620Q4KN68 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01620Q4KN68 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 533.4 ms