Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD55Q3KP44 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD55Q3KP44 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD55Q3KP44 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD55Q3KP44 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms