Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A9Q2M3M2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC5A9Q2M3M2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC5A9Q2M3M2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A9Q2M3M2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A9Q2M3M2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A9Q2M3M2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC5A9Q2M3M2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC5A9Q2M3M2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A9Q2M3M2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC5A9Q2M3M2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC5A9Q2M3M2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms