Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3R2Q15599 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3R2Q15599 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3R2Q15599 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A3R2Q15599 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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