Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC23BQ15437 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC23BQ15437 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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SEC23BQ15437 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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SEC23BQ15437 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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SEC23BQ15437 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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SEC23BQ15437 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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SEC23BQ15437 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC23BQ15437 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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